´ó»ï¶ùÓ¦µ±¶¼Á˽âÇ×Ë®ÐÔЧÓã¨hydrophobic effect£©£¬¼´ÈÜÒºÖзǼ«ÐÔ·Ö×ÓÕÛµþʽ»òÖÊ×Ó»¯µÄ×´¿ö£¬ËµÊµ»°±ãÊÇ£¬ÓÍÓëË®²»ÏàÈÜ¡£
Ç×Ë®ÐÔЧÓÃ˵ÆðÀ´·Ç³£¼òµ¥ÐÎÏ󻯣¬µ«ËüÔòÊǸöÐĺÝÊÖÀ±£¡ÀýÈ磬ÔÚµ°ÇåÕÛµþʽ¡¢Ò©Æ·-µ°ÇåÏ໥ӰÏ죬¼°µ°Çå-µ°ÇåÏ໥ӰÏìÖУ¬Ç×Ë®ÐÔЧÓþ³£ÊǹؼüÐÔÔÒòÖ®Ò»ÄØ[1]£¡
˵µ½ÊèË®ÐÔÔÚÒ©Æ·-µ°ÇåÏ໥ӰÏìÖеÄÖ÷ҪΣº¦£¬Êµ¼ÊÉϾø´ó¶àÊý·¢ÊÛµÄС·Ö×ÓÒ©ÎﶼÊÇÓÐÒ»¶¨µÄÊèË®ÐÔ[2]¡£ÊÔÑéÒ²±íÃ÷£¬Ç×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏì¶ÔÈںϵķîÏ×ÊÇÊ®·Ö¼«´óµÄ£¬¿ÉÒÔ×öµ½Ô¼30 cal / (mol¡¤ ?)¡£Õâ¸öÊÇʲôÀíÄîÄØ£¿ÀýÈ磬¼ÓÉÏÒ»¸öôÇ»ù£¨-CH3£©Ôì³ÉµÄÇ×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏ죬¶Ô½áºÏ×ÔÓÉÄܵķîÏ×ÊÇ0.7kcal/mol£¬»»¾ä»°Ëµ¿ÉÒÔÌá¸ß3.5±¶ÉÏϵĻîÁ¦[1]!
Ç×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏìÕâ°ã¹ã·ºÓÖÕâ°ã¹Ø¼ü£¬ÄãÊÇ·ñ»áºÜºÃÆ棬ËüµÄʵÖʾ¿¾¹ÊÇʲô£¿àÅ£¬´ó¼Ò±ãÊÇÉÍÎöÕâÀà×·Ñ°µÄ¾«ÉñʵÖÊ£¡½ñÈÕ£¬ÎҾͺʹó¼ÒÉî°ÇÒ»ÏÂÇ×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏ죬¶øÇÒ»¹»á¼ÌÐø̸µ½¶þºÅÖ÷È˹«£ºÈ¥ÓлúÈܼÁ»¯£¨Desolvation£©¡£
˵µ½¹²¼Û¼ü»òÊÇÀë×Ó¼üµÄʵÖÊ£¬¿ÉÒÔ½âÊÍΪµç×ÓÔÆÒ»¶¨µÄ³Ì¶ÈµÄ±é²¼Ïàµþ»òÊǾ²µç¸ÐÓ¦Ï໥ӰÏì¡£¿ÉÊÇ£¬Ç×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏìȴû·¨´ÓÔ×Ó¼äµÄÁ¦À´Á˽⣬ÀýÈçÄãÎÞ·¨±íÊö±½»·ÉϵÄÒ»¸ö̼Ô×Óµ½µ×ÊÇÀûÓÃÄÄЩÔ×Ó¼äÏ໥×÷ÓÃÁ¦¹´ÒýÉÏôÇ»ùµÄ̼Ô×Ó£¬²úÉúÇ×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏìµÄ¡£
ÄÇüN£¬Íƶ¯Ç×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏìµÄµ½µ×ÊǺÎÐíÈËÒ²ÄØ£¿
˵³öÀ´£¬Êµ¼ÊÉÏÒ»µãÒ²²»ÃØÃÜ£¬Ëü±ãÊÇ¡°ìØ¡±£¨Entropic£©[3]£¡¾ÅÓλáJ9ÕæÈËÖªµÀÔÚ¿Øκãѹ¹ÜÀíÌåϵÏ¿ÉÒÔÓüª²¼Ë¹×ÔÓÉÄÜ£¨Gibbs Free Energy£©·Ö±æÈÈѧȫ¹ý³ÌÊDz»ÊÇ×Ô·¢ÐÔ£¬Æä·½³ÌʽÈçÏÂËùʾ£º
¦¤G=¦¤H?T¦¤S
ÕâÒ»·½³ÌʽҲÀ´ÐðÊöÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈµÄÈÚ½âÈ«¹ý³Ì£¬µ±¦¤G<0Òâζ×ÅÈÚ½âÈ«¹ý³Ì×Ô·¢ÐÔ£¬Ïà·´Ôò²¢²»ÊÇ¡£±í´ïʽÖЦ¤HÖ¸ìʱ䣬¦¤SÖ¸µÄÊÇìر䡣
ʵ¼ÊÉÏÕâÒ»·½³Ìʽ»¹¿ÉÒÔÓÃÓÚÐðÊöÒ©Æ·Îü¸½ºÍµ°ÇåµÄÏ໥ӰÏìÈ«¹ý³Ì£ºÒ»ÇеÄÒ©Æ·ÈÚºÏÈ«¹ý³Ìʵ¼ÊÉÏÈ«ÊÇìʱäºÍìرäµÄһͬ½Y¹û£¬½ö½ö¾ÅÓλáJ9ÕæÈËÔÚÁ˽âÈÚºÏÈ«¹ý³Ìʱͨ³£ºöÊÓÁËìرäµÄ¹¦Ð§¡£
ìØ£¬ÊÇɶÍæÒâ¶ùÄØ£¿¹Ù·½Íø½ç¶¨£¬ìØÊǹÜÀíÌåϵÏÂÈ«²¿Íⲿ¾¼ÃÇé¿öÊýµÄ×ÜÊýµÄµ±È»¶Ô±êÖµ³ËÓÚ²£¶û×ÈÂü³£Êý¡£¶ÔÕâÒ»½ç¶¨²»Ã÷°×Ҳûʶù£¬´ó¼ÒÖ»±ØÐëÁ˽⣬´Ó»î»¯ÄܵÄÊӽǣ¬¼ÙÈçijÀàת±ä´Ùʹ¹ÜÀíÌåϵÓÐÔ½¶àµÄÇé¿öÊý£¬ÔòÓÐÒæÓÚÕâÀàת±äµÄ×Ô·¢ÐÔ¡£
·µ»Ø´ó¼ÒµÄÎüË®¹¦Ð§ÉÏ£¬Èç¹û¾ÅÓλáJ9ÕæÈ˽«ÊèË®ÐÔµÄÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÈÓ½øË®ÀÄǻÄÜÔõÑùת±äÄØ£¿×îÏÈË®ÀïÔ±¾µÄ¹²¼Û¼ü»¥ÁªÍø¿ÉÄܱ»»Ù»µÒÔ¿Õ³öλÖøøÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶È£¬ÕâÊÇÒ»¸öÎüÈÈ·´Ó¦È«¹ý³Ì¡£Ëæºó£¬ÔÚÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÖܱߣ¬Ë®·Ö¿ÉÄܲúÉúÒ»¸öÏà½üÇôÀεĹ¹Ô죬²úÉú¸üΪ¾®È»ÓÐÐòµÄ¹²¼Û¼ü¡£
´ó¼ÒϸÏëһϻᷢ¾õ£¬Õû¸ö¹ý³ÌÖеÄìʱ䣨¦¤H£©²»ºÃ˵ÊÇÕý¡¢¸º»òÊÇÏàͬµÄ£¬ÓÉÓÚвúÉúµÄ¹²¼Û¼üÒ²ÐíÄÜÅâ³¥µÚÒ»²½ÇжϵĹ²¼Û¼üµÄ¶¯ÄÜ¡£¿ÉÊÇ£¬ÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÖܱ߸üΪ¾®È»ÓÐÐò£¨½á¹¹ÐÍ£©µÄË®·Ö½«´Ùʹ¹ÜÀíÌåϵµÄìر䣨¦¤S£©¼õÉÙ£¬¶øÇÒÕâһת±äͨ³£±ÈìʱäµÄת±ä¸ü¸ß¡£ÒÀ¾Ý¼ª²¼Ë¹×ÔÓÉÄܹ«Ê½¼ÆË㣬¦¤G=¦¤H?T¦¤S£¬½ÏСµÄ¦¤H£¨Õý¸º¼«²»Ã÷£©¼õµôÒ»¸ö¸ºµÄ±È½Ï´óµÄ¦¤S£¬ÕâÒ»½Y¹ûÊÇÕýµÄ£¬Òâζ×Å×ÅÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶Èû·¨×Ô·¢ÐÔµÄÈڽ⵽ˮÀï¡£µ±ÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶È¼¯¾Ûʱ£¬ÕâÒ»¼¯¾ÛµÄ×ÜÌåÓëË®µÄÁ˽â±í²ã±ÈÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶È³¹µ×ÔȳƷÖÉ¢»¯ÔÚ±¥ºÍÈÜÒºÖеÄÁ˽âÃæС£¬¿Æѧ»¯µÄË®·Ö½µÖÁÖÁÉÙ£¬ËæÒâµÄ¡¢ÓдóÁ¿Çé¿öÊýµÄË®·Ö×öµ½½Ï¶à£¬Óë´ËͬʱìØÒ²½Ï´ó£¬Õâ¾ÍÊÇÇ×Ë®ÐÔЧÓá£
ͼÖбíÃ÷²»Ò»Ñù»·¾³Î¶ÈÏÂÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÈÚ½âµÄìʱ䡢ìرäºÍ¼ª²¼Ë¹×ÔÓÉÄÜת±ä¡£ºá×ø±êÒâζ×Ų»Ò»ÑùœØ¶È¡£ÏÂ×óͼÊÇLJÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÈڽ⵽MBÈÜÒºÖеĻù´¡ÀíÂÛÔ¤²â·ÖÎö½Y¹û£¬ÏÂͼÊÇÇ×Ë®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈÈÚ½âµÄÑо¿½Y¹û¡£ºá×ø±êÒâζ×Ŝضȣ¬Äܹ»¿´¼û²»Ò»Ñù»·¾³Î¶ÈÏÂÊèË®ÐÔÎïÖʵÄÁ¿Å¨¶ÈµÄÈڽ⼪²¼Ë¹×ÔÓÉÄÜÈ«ÊÇÕýµÄ£¬»»¾ä»°Ëµ£¬²»¿ÉÒÔ×Ô·¢ÐÔÈڽ⡣
·µ»ØС·Ö×ÓÒ©ÎïÓëµ°ÇåÏ໥ӰÏì¹ÜÀíÌåϵÉÏ£¬Èç½ñÓÐЩÈËѯÎÊÄ㣬ΪºÎÌí¼ÓÊèË®ÐÔdna¿ÉÒÔÌáÉýÒ©Æ··Ö×ӽṹµÄ»îÁ¦ÄØ£¿Àí½âÁËÈçÉÏËùÊöµÄ¹¥ÂÔ´óÈ«£¬ÊDz»ÊÇÄãºÜ¼òµ¥µØ¾ÍÄÜÕÒµ½´ð°¸£ºÓÉÓÚÊèË®ÐÔ¹ÙÄÜÍŽøµ½ÊèË®ÐԵĵ°Çå´ü×Ó£¬´Ùʹ²úÆ·µÄÊèË®ÐÔ¹ÙÄÜÍž¡Á¿±ÜÃâµÄй¶ÔÚÈÜÒºÖУ¬Òò´Ë¾Íʹ¹ÜÀíÌåϵ¸üΪƽÎȽø¶øÌá¸ß»îÁ¦¡£ÕâÒ»»ØÓ¦¿ÉÒÔ¸ø100·Ö°É£¿^_^
¿ÉÊÇÄØ£¬»¹Ã»ÍêûÁË£¬¼ÙÈçÎÒÒª¸æËßÄ㣬Ç×Ë®ÐÔ¹ÙÄÜÍÅÓëÇ×Ë®»ùÍŵĸü»»£¬ÄËÖÁ¿ÉÒÔÈûîÁ¦×ª±ä4ǧ±¶£¬ÄãÊÇ·ñ»á¸Ð¾õÄÑÒÔÏëÏó£¿
À´£¬²»»Å£¬´ó¼ÒÔÙ´ÎÁÄ~ С¹ÊÊ»òÊǵôÓÇ×Ë®ÐÔЧÓÃ̸Æð£ºÔÚһЩ¹ÜÀíÌåϵÖУ¬ÊèË®ÐÔµ°Çå±í²ãÓÃһЩÊʺϵÄÊèË®ÐÔ·Ö×ÓÕ¼ÓУ¬´ó¼Ò·¢¾õ£¬Õâ¶Ô½áºÏ×ÔÓÉÄܵķîÏ׿ÉÒÔ×öµ½ºÃ¶à¸ökcal/mol [4]£¡ÀýÈçϱßÕâÒ»ÊÂÀý£º
factor XaºÍÆ仺¾Û¼ÁµÄ½á¾§Ìå¹¹Ô죨PDB Code 2j4i£©
ͼÖÐÊÇfactor XaºÍÆ仺¾Û¼Á£¨From GSK£©µÄ½á¾§Ìå¹¹Ô죨PDB Code 2j4i£©£¬ÆäKiÊÇ1nM£¬¿ÉÊǼÙÈ罫ͼÀýÖиßչʾµÄÒì±û»ù»»³ÉÇ⣨H£©£¬Æä»îÁ¦Á¢¼´½µµÍµ½39¦ÌM£¬»îÁ¦Á¢¼´Ïà¾àÁË4ǧ±¶£¡
ͼÖÐÊÂÀýÖÐÄܹ»¿´¼û£¬Tyr99¡¢Trp215ºÍPhe174¹¹³ÉµÄÊèË®ÐÔµÄÈÚºÏÄÚÇ»£¬¸ù¾ÝÅäλÉϵÄÒì±û»ù²úÉúÇ×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏ죬½ø¶øÌáÉý»îÁ¦¡£¿ÉÊÇÕâÒ»´Î£¬²»ÌáÔòÒÑ£¬Ò»Ìá±ãÊÇÁîÈËÕ𾪵Ä4ǧ±¶£¡ÕâÊÇΪʲôÄØ£¿
˵ÆðÇåÎúÕâ¸öÎÊÌ⣬¾ÍµÃÇë³ö½ñÈյĶþºÅÖ÷È˹«£¬Ò²ÊÇ´ó»ï¶ùÔÚÒ©Æ·Éè¼Æ·½°¸Öзdz£ÈÝÒ׺öÊӵģ¬È¥ÓлúÈܼÁ»¯Ð§Óã¨desolvation£©¡£
ÈçÏÂͼÇå³þµÄÐðÊöÁ˸ÃÈ«¹ý³Ì£¬Ò©Æ··Ö×ӽṹÔÚÈÜÒº×ÔÈ»»·¾³Àï½øµ½°Ðµãµ°ÇåÈÚºÏÄÚÇ»µÄ»·½ÚÖУ¬±ØÐë°ÚÍÑÔÏȵÄË®»·¾³£¬¶øÇÒ½«°ÐµãÈںϴü×ÓÖеÄË®ÅųöÀ´£¬ÕâÒ»»·½ÚÖÐËðºÄ»òµÃµ½µÄ¶¯ÄܱãÊÇÈ¥ÓлúÈܼÁ»¯ÄÜ¡£
ÔÚË®»·¾³ÖÐÒ©Æ··Ö×ӽṹ½øµ½µ°ÇåÈÚºÏÄÚÇ»µÄÈ«¹ý³ÌƽÃæͼ
·µ»Øfactor XaµÄÊÂÀý£¬¾ÅÓλáJ9ÕæÈËÔÚ3D¹¹ÔìÖп´Ò»ÏÂÈںϴü×ӵIJ¿Î»£¨ÏÂÃæµÄͼ£©£¬ºÜÏÔÖø£¬Èںϴü×Ó²¢Ã»ÓÐÉî²ã´Îµ°°×ƒÈ²¿£¬·´¶øÊÇÔÚ°¤½üÓлúÈܼÁËù¼°µÄ±í²ã¡£¼Ù¶¨›]ÓÐÊèË®ÐÔµÄÒì±û»ùÕ¼ÓУ¬ÊèË®ÐÔÄÚÇ»²¿Î»ºÜÓпÉÄÜÕ¼ÓÐ×ÅһЩˮ·Ö£¬Ò»ÑùÕâÖÖÔÚÇ×Ë®ÐÔ±í²ãµÄË®·Ö»áÓú·¢µÄ¾®È»ÓÐÐòÆäÇé¿öÊý»á½ÏÉÙ£¬½ø¶ø¶Ô½áºÏ×ÔÓÉÄÜÓв»ºÃµÄ·îÏ×£»¶ø¸ù¾ÝÒì±û»ù¿ÉÒÔÐÖúÅųöÀ´ÕâÖÖË®·Ö£¬½ø¶øµÃµ½³ý¿ªÇ×Ë®ÐÔÏ໥ӰÏìÍâµÄÒ»²¿·Ö¶¯ÄÜ£¬Òò´Ë»îÁ¦±»´ó´óµÄÔöÇ¿ÁË[5£¬6]¡£´ÓÕâÒ»ÊÂÀýÖоÅÓλáJ9ÕæÈË¿ÉÒÔ¼ûµ½£¬Ò©Æ·Éè¼Æ·½°¸Öдó¼Ò»¹Òª¿¼Âǵ½ÔÚÎÞÅäλÈÚºÏÇé¿öÏÂÈںϴü×ÓºÜÓпÉÄܵÄË®»¯Çé¿ö£¡
ͼÖÐÄܹ»¿´¼û2j4iÖеÄÅäλÈںϴü×ÓÔÚ°¤½üµ°Çå±í²ã£¬´¦ÔÚÓлúÈܼÁ·Ç³£ÈÝÒ×½øµ½µÄµØÇø¡£ÏʺìÉ«²¿·ÖÒâζ×ÅÆضÓлúÈܼÁÖеĵØÇø£¬ÇàÂÌÉ«Òâζ×ÅÇ×Ë®ÐÔµØÇø£¬·ÛºìÉ«Òâζ×ÅÕý¸º¼«¹ÙÄÜÍŵØÇø¡£
Ìرð×¢ÒâµÄÊÇ£¬È¥ÓлúÈܼÁ»¯Ò²ÊÇÓн«»á»áµ¼Ö¿´ÉÏÈ¥¿ÉÒÔÓÐЧµØÓëµ°°×¼¤Ã¸ÈںϵķÖ×ӽṹʵ¼ÊÉϲ¢ÎÞ·¨ÓÐЧµØÈںϡ£ÀýÈçÔÚÒ»¸ö¶ÔÓÚHIV-1µ°°×øÒÖÖƼÁ¿¹Ò©ÐÔµÄ̽ÌÖÖз¢¾õ£¬ÓÉÓÚ»ùÒòÍ»±äÔì³ÉÈںϴü×ÓµÄÈ¥ÓлúÈܼÁ»¯ÄÜÃ÷ÏÔÌáÉý£¬½ø¶øÖÂʹÁË¿¹Ò©ÐÔ[7]¡£
ÔÙÀýÈçÔÚÓÐàßòßøĸ»·µÄ»¯Ñ§ÎïÖÊÊÇÒ»Àà¹Ø¼üµÄEGFR£¨epidermal growth factor receptor£¬ÍâƤת»¯³ÉÒòËص°°×¼¤Ã¸£©»º¾Û¼Á£¬¼ª·ÇÌæÄáºÍÌØÂÞ¿¶¼¹éÊôÓÚ¸ÃÀàÒ©¡£ÀýÈçÏÂÃæµÄͼµÄ2¸ö»¯Ñ§ÎïÖÊ£¬ÏÂ×óͼΪ֪ÃûÒ©Æ·ÌØÂÞ¿£¬ÏÂͼΪ²ì¾õµÄ´ËÍâÒ»¸öͬϵµÄEGFR»º¾Û¼Á£¨¹ÃÇÒ³Æ֮Ϊ»¯Ñ§ÎïÖÊA£©[8]¡£ÏÂͼ»¯Ñ§ÎïÖÊAÄÜÓëEGFR µÄAsp776²úÉúÀë×Ó¼ü£¬´ó»ï¶ùÁ˽âÀë×Ó¼üÄܵ½´ïµÄ¼üÄÜÊǽÏÇ¿µÄ£¬ÀíÂÛÉÏ£¬ÓëÌØÂÞ¿¶Ô±È£¬»¯Ñ§ÎïÖÊAµÄ»îÁ¦Ìá¸ßÓ¦µ±Ô¶Ô¶²»Ö¹10±¶¡£
ͼÖÐΪ»¯Ñ§ÎïÖÊAºÍÌØÂÞ¿µÄµþºÏ½Y¹û£¬Äܹ»¿´¼û»¯Ñ§ÎïÖÊAÄܺÍAsp776²úÉú¼üÄܼ«Ç¿µÄÀë×Ó¼ü£¬¿ÉÊÇ»îÁ¦È´Ö»Ìá¸ßÁË10±¶£¡Êµ¼ÊÉÏÕâÒ²ÊÇÒòΪȥÓлúÈܼÁ»¯ÄܵÄΣº¦£¬Asp776×øÂäÓÚÓлúÈܼÁËù¼°µÄµ°Çå±í²ãÉÏ£¬·Ç³£ÈÝÒ×ÓëË®²úÉú±È½ÏƽÎȵĹ²¼Û¼ü£¬Òò¶øÒªÓë-NH3 ¹¦Ð§Ê±Îñ±Ø°ÚÍÑÓëһЩˮ·ÖµÄЧ¹û¶øÏûºÄÒ»¶¨µÄ¶¯ÄÜ¡£Í¬Ñù£¬»¯Ñ§ÎïÖÊAÉϵÄ-NH3 Ò²ÊÇÒ»ÑùµÄ£¬±ØÐë¶ÏµôÒ»²¿·ÖÓëË®²úÉúµÄ¹²¼Û¼üÈ¡¾öÓÚAsp776µÄôÈ»ùÏ໥ӰÏì¡£Òò¶ø¿´ÆðÀ´²úÉú½ÏÇ¿µÄ¹²¼Û¼ü£¬¿ÉÊÇÒòΪȥÓлúÈܼÁ»¯µÄ¹¦Ð§£¬Æä»îÁ¦µÄÔöÇ¿²»Ò»¶¨ÓÐÏëÏñÖеÄÀíÏ뻯¡£
¸ÃÎÄÕÂÄÚÈÝÌá¸ßÉ¢²¥Ð¼¼ÊõÓ¦ÓÃÐÂÎÅ×ÊѶ£¬ºÜÓпÉÄÜÓÐת½Ø/ÒýÈëÖ®×´¿ö£¬ÈôÓÐÇÖȨÐÐΪÇëÁªÂçɾµô¡£
ÉÏһƪ: ±íÃ湦ÄÜ΢Äɽṹ¼°Æä¼Ó¹¤·½·¨½éÉÜ
ÏÂһƪ: ľ²ÄÍâ¹Û×ÔÐÞ¸´³¬ÊèˮͿ²ãµÄ¹¹½¨